Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFA0

USP32, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32, humanhuman

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP32Q8NFA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
USP32Q8NFA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
USP32Q8NFA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
USP32Q8NFA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP32Q8NFA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP32Q8NFA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms