Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF680Q8NEM1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF680Q8NEM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF680Q8NEM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF680Q8NEM1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF680Q8NEM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms