Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNTD1Q8N9Z9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LMNTD1Q8N9Z9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms