Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
VWDEQ8N2E2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
VWDEQ8N2E2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
VWDEQ8N2E2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms