Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCML4Q8N228 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCML4Q8N228 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms