Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN4Q8IWV2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN4Q8IWV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN4Q8IWV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNTN4Q8IWV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms