Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWA5

SLC44A2, Choline transporter-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A2Q8IWA5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC44A2Q8IWA5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC44A2Q8IWA5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC44A2Q8IWA5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms