Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV50

LYSMD2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD2Q8IV50 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYSMD2Q8IV50 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYSMD2Q8IV50 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYSMD2Q8IV50 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms