Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLD3Q8IV08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLD3Q8IV08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLD3Q8IV08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLD3Q8IV08 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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