Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
DZIP3Q86Y13 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DZIP3Q86Y13 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DZIP3Q86Y13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms