Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SETD3Q86TU7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SETD3Q86TU7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SETD3Q86TU7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SETD3Q86TU7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms