Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ATG9AQ7Z3C6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATG9AQ7Z3C6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ATG9AQ7Z3C6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATG9AQ7Z3C6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms