Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETXQ7Z333 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETXQ7Z333 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETXQ7Z333 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms