Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HS2ST1Q7LGA3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HS2ST1Q7LGA3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HS2ST1Q7LGA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HS2ST1Q7LGA3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms