Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD7Q6ZUT3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD7Q6ZUT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD7Q6ZUT3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD7Q6ZUT3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms