Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LINC00299Q6ZSB3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00299Q6ZSB3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00299Q6ZSB3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms