Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC129Q6ZRS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC129Q6ZRS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC129Q6ZRS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms