Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXT8

ALKAL1, ALK and LTK ligand 1, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1Q6UXT8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKAL1Q6UXT8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALKAL1Q6UXT8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALKAL1Q6UXT8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALKAL1Q6UXT8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms