Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VITQ6UXI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VITQ6UXI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VITQ6UXI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms