Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SHC4Q6S5L8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHC4Q6S5L8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SHC4Q6S5L8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHC4Q6S5L8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms