Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5H4

POTEB, POTE ankyrin domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEBQ6S5H4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.54■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POTEBQ6S5H4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
POTEBQ6S5H4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POTEBQ6S5H4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms