Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
LARP1Q6PKG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LARP1Q6PKG0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LARP1Q6PKG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
LARP1Q6PKG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms