Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK18

OGFOD3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3Q6PK18 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OGFOD3Q6PK18 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OGFOD3Q6PK18 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OGFOD3Q6PK18 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms