Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNV1Q6PIU1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNV1Q6PIU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNV1Q6PIU1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCNV1Q6PIU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.7 ms