Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP4Q6PIL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms