Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL54Q6P161 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MRPL54Q6P161 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MRPL54Q6P161 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms