Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ANKRD54Q6NXT1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ANKRD54Q6NXT1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ANKRD54Q6NXT1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 922.8 ms