Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCM7

SLC25A25, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A25Q6KCM7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A25Q6KCM7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A25Q6KCM7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A25Q6KCM7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A25Q6KCM7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms