Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CARMIL2Q6F5E8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CARMIL2Q6F5E8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CARMIL2Q6F5E8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CARMIL2Q6F5E8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms