Protein–RNA interactions for Protein: Q69YG0

TMEM42, Transmembrane protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM42Q69YG0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM42Q69YG0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM42Q69YG0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM42Q69YG0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms