Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG16L1Q676U5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms