Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCNX4Q63HM2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCNX4Q63HM2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCNX4Q63HM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCNX4Q63HM2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms