Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FOCADQ5VW36 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FOCADQ5VW36 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOCADQ5VW36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOCADQ5VW36 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms