Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATRNL1Q5VV63 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATRNL1Q5VV63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATRNL1Q5VV63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATRNL1Q5VV63 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms