Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUD1Q5VV17 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUD1Q5VV17 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUD1Q5VV17 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUD1Q5VV17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUD1Q5VV17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms