Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIF1Q5UIP0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIF1Q5UIP0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIF1Q5UIP0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms