Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HES3Q5TGS1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HES3Q5TGS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HES3Q5TGS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES3Q5TGS1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms