Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLC9C2Q5TAH2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLC9C2Q5TAH2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC9C2Q5TAH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLC9C2Q5TAH2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC9C2Q5TAH2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC9C2Q5TAH2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC9C2Q5TAH2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms