Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
CCDC18Q5T9S5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
CCDC18Q5T9S5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CCDC18Q5T9S5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CCDC18Q5T9S5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CCDC18Q5T9S5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms