Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIVEP3Q5T1R4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIVEP3Q5T1R4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIVEP3Q5T1R4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms