Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CELF3Q5SZQ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CELF3Q5SZQ8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CELF3Q5SZQ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms