Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNFT1Q5M7Z0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNFT1Q5M7Z0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNFT1Q5M7Z0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNFT1Q5M7Z0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms