Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYL7

TMEM196, Transmembrane protein 196, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM196Q5HYL7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM196Q5HYL7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM196Q5HYL7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM196Q5HYL7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM196Q5HYL7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms