Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR3Q5GH77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR3Q5GH77 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR3Q5GH77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms