Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAB6CQ53S08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB6CQ53S08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB6CQ53S08 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.6 ms