Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHLDA2Q53GA4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHLDA2Q53GA4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHLDA2Q53GA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PHLDA2Q53GA4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms