Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKDCCQ504Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKDCCQ504Y2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKDCCQ504Y2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PKDCCQ504Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PKDCCQ504Y2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms