Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCTN1Q2MV58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCTN1Q2MV58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCTN1Q2MV58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCTN1Q2MV58 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms