Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST2H2ACQ16777 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST2H2ACQ16777 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST2H2ACQ16777 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
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