Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
FOXD1Q16676 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
FOXD1Q16676 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXD1Q16676 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXD1Q16676 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXD1Q16676 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
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